Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED2Q99967 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED2Q99967 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms