Protein–RNA interactions for Protein: Q96MV1

TMEM56, Transmembrane protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM56Q96MV1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM56Q96MV1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM56Q96MV1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms