Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf48Q96LL4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf48Q96LL4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms