Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PGBD1Q96JS3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PGBD1Q96JS3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PGBD1Q96JS3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 788.8 ms