Protein–RNA interactions for Protein: Q925J9

Med1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med1Q925J9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Med1Q925J9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Med1Q925J9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Med1Q925J9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms