Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf144aQ925F3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Rnf144aQ925F3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf144aQ925F3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Rnf144aQ925F3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf144aQ925F3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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