Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spdl1Q923A2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spdl1Q923A2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spdl1Q923A2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms