Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Synpo2Q91YE8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Synpo2Q91YE8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms