Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CSRNP3Q8WYN3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
CSRNP3Q8WYN3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CSRNP3Q8WYN3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms