Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCOLN3Q8TDD5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCOLN3Q8TDD5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms