Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DTX3LQ8TDB6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DTX3LQ8TDB6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DTX3LQ8TDB6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms