Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CipcQ8R0W1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CipcQ8R0W1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CipcQ8R0W1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CipcQ8R0W1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms