Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HACE1Q8IYU2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HACE1Q8IYU2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms