Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC83Q8IWF9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC83Q8IWF9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC83Q8IWF9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms