Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Card11Q8CIS0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
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Card11Q8CIS0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
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Card11Q8CIS0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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Card11Q8CIS0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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Card11Q8CIS0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
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Card11Q8CIS0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
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Card11Q8CIS0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Card11Q8CIS0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
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Card11Q8CIS0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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Card11Q8CIS0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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Card11Q8CIS0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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Card11Q8CIS0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
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Card11Q8CIS0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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Card11Q8CIS0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Card11Q8CIS0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Card11Q8CIS0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
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