Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ClasrpQ8CFC7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClasrpQ8CFC7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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