Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E4f1Q8CCE9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E4f1Q8CCE9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E4f1Q8CCE9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms