Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc30Q8BVF4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc30Q8BVF4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc30Q8BVF4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms