Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcl3Q8BVF2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms