Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
6820408C15RikQ8BJX2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
6820408C15RikQ8BJX2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
6820408C15RikQ8BJX2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms