Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW1

Fto, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FtoQ8BGW1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FtoQ8BGW1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FtoQ8BGW1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FtoQ8BGW1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FtoQ8BGW1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FtoQ8BGW1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FtoQ8BGW1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FtoQ8BGW1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FtoQ8BGW1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FtoQ8BGW1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FtoQ8BGW1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FtoQ8BGW1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FtoQ8BGW1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FtoQ8BGW1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms