Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDXQ7Z353 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDXQ7Z353 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms