Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ckap2lQ7TS74 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ckap2lQ7TS74 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms