Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc93Q7TQK5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc93Q7TQK5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1087.9 ms