Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf139Q7TMV1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf139Q7TMV1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms