Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Rtl1Q7M732 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rtl1Q7M732 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rtl1Q7M732 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rtl1Q7M732 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms