Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
LRRC9Q6ZRR7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRC9Q6ZRR7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LRRC9Q6ZRR7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms