Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC36A4Q6YBV0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A4Q6YBV0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC36A4Q6YBV0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC36A4Q6YBV0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms