Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L3Q6VB84 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4L3Q6VB84 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms