Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Szrd1Q6NXN1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Szrd1Q6NXN1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms