Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr44Q6NVE8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Wdr44Q6NVE8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr44Q6NVE8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.9 ms