Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APOBEC3HQ6NTF7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
APOBEC3HQ6NTF7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
APOBEC3HQ6NTF7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC3HQ6NTF7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms