Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retreg2Q6NS82 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retreg2Q6NS82 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retreg2Q6NS82 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms