Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ggnbp1Q6K1E7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ggnbp1Q6K1E7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms