Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ddx11Q6AXC6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx11Q6AXC6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx11Q6AXC6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.9 ms