Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rftn1Q6A0D4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rftn1Q6A0D4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rftn1Q6A0D4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms