Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg9aQ68FE2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg9aQ68FE2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg9aQ68FE2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms