Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhocQ62159 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RhocQ62159 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhocQ62159 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhocQ62159 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhocQ62159 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RhocQ62159 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RhocQ62159 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RhocQ62159 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RhocQ62159 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RhocQ62159 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RhocQ62159 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RhocQ62159 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RhocQ62159 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RhocQ62159 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhocQ62159 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhocQ62159 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RhocQ62159 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhocQ62159 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RhocQ62159 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms