Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smarcd1Q61466 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smarcd1Q61466 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smarcd1Q61466 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms