Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd1Q61345 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxd1Q61345 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxd1Q61345 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.2 ms