Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psmb6Q60692 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmb6Q60692 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms