Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prdm1Q60636 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm1Q60636 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm1Q60636 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.5 ms