Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc125Q5U465 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc125Q5U465 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc125Q5U465 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms