Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
WASHC2DQ5SRD0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WASHC2DQ5SRD0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WASHC2DQ5SRD0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms