Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc88aQ5SNZ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc88aQ5SNZ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms