Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm12185Q5NCB2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm12185Q5NCB2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm12185Q5NCB2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm12185Q5NCB2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm12185Q5NCB2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm12185Q5NCB2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm12185Q5NCB2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm12185Q5NCB2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm12185Q5NCB2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm12185Q5NCB2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm12185Q5NCB2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm12185Q5NCB2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm12185Q5NCB2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.9 ms