Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd28Q505D1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd28Q505D1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms