Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syne3Q4FZC9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syne3Q4FZC9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syne3Q4FZC9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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