Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Carmil2Q3V3V9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil2Q3V3V9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Carmil2Q3V3V9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil2Q3V3V9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms