Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Esf1Q3V1V3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Esf1Q3V1V3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Esf1Q3V1V3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Esf1Q3V1V3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1259.7 ms